Tan ambicioso como su padre, Joseph Patrick "Joe Jr." Kennedy estaba llamado a encabezar una dinastía, y su padre soñaba con que acabase siendo el primer presidente irlandés de los Estados Unidos -como después lo fue su hermano menor, John Fitzgerald-. Sin embargo, moriría quince años antes.
Joe Kennedy era un absoluto amante de la aviación. De hecho, fue piloto en la Marina, y siguió ejerciendo de piloto militar más adelante, a pesar de la oposición de algunos de sus familiares.
El 12 de Agosto de 1944, se encontraba trabajando como piloto de refuerzo en aviones no tripulados en la llamada Operación Afrodita, en Gran Bretaña, durante la II Guerra Mundial. Estos aviones eran bombarderos controlados de manera remota, pero necesitaban una tripulación humana mínima de dos personas para asegurar el despegue. 'Joe' Kennedy, confiado de sus capacidades, se prestó voluntario.
Sin embargo, durante la operación, una de las bombas estalló en pleno vuelo, acabando instantáneamente con la vida de Joseph Jr.
En el mismo aeroplano viajaba el teniente John Willy Wilford, quien también falleció en la explosión.
